На WinCE 4.2 и WinCE 6.0 база и настройки должны подхватиться автоматически т.к. РМК POScenter ставится в ту же папку.
На Win32 релиз от ПОСцентра ставится в папку Poscenter:
C:\Program Files (x86)\Poscenter\Кассир мини
И начиная с Win8 ОС хранит данные программ в папке VirtualStore, соответственно, для переноса базы и настроек от Штриховской версии РМК, Вам надо скопировать файлы common.txt и rmk.sdf из папки
C:\Users\UserName\AppData\Local\VirtualStore\Program Files (x86)\ШТРИХ-М\Кассир мини\DB
в папку
C:\Users\UserName\AppData\Local\VirtualStore\Program Files (x86)\Poscenter\Кассир мини\DB